Protein–RNA interactions for Protein: P20226

TBP, TATA-box-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBPP20226 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBPP20226 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBPP20226 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TBPP20226 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBPP20226 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBPP20226 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TBPP20226 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBPP20226 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TBPP20226 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TBPP20226 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TBPP20226 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBPP20226 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBPP20226 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TBPP20226 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBPP20226 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TBPP20226 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBPP20226 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TBPP20226 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TBPP20226 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TBPP20226 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBPP20226 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBPP20226 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBPP20226 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TBPP20226 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBPP20226 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBPP20226 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBPP20226 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBPP20226 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBPP20226 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TBPP20226 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBPP20226 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBPP20226 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBPP20226 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBPP20226 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBPP20226 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBPP20226 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBPP20226 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBPP20226 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBPP20226 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBPP20226 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBPP20226 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBPP20226 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBPP20226 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBPP20226 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBPP20226 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBPP20226 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBPP20226 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBPP20226 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBPP20226 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBPP20226 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TBPP20226 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBPP20226 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBPP20226 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBPP20226 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBPP20226 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBPP20226 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBPP20226 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBPP20226 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBPP20226 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBPP20226 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBPP20226 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBPP20226 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBPP20226 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBPP20226 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBPP20226 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBPP20226 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBPP20226 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBPP20226 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TBPP20226 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TBPP20226 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBPP20226 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBPP20226 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBPP20226 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TBPP20226 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBPP20226 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBPP20226 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBPP20226 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBPP20226 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBPP20226 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBPP20226 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBPP20226 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBPP20226 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBPP20226 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBPP20226 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBPP20226 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBPP20226 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBPP20226 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBPP20226 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBPP20226 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBPP20226 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBPP20226 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBPP20226 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBPP20226 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBPP20226 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBPP20226 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBPP20226 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBPP20226 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBPP20226 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBPP20226 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBPP20226 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms