Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCF3P15923 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCF3P15923 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF3P15923 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF3P15923 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF3P15923 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF3P15923 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF3P15923 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF3P15923 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF3P15923 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF3P15923 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF3P15923 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF3P15923 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TCF3P15923 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TCF3P15923 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCF3P15923 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCF3P15923 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCF3P15923 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCF3P15923 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCF3P15923 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCF3P15923 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCF3P15923 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCF3P15923 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCF3P15923 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCF3P15923 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCF3P15923 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCF3P15923 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCF3P15923 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCF3P15923 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCF3P15923 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TCF3P15923 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCF3P15923 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCF3P15923 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCF3P15923 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCF3P15923 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCF3P15923 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCF3P15923 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCF3P15923 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCF3P15923 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TCF3P15923 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCF3P15923 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCF3P15923 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCF3P15923 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCF3P15923 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCF3P15923 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCF3P15923 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCF3P15923 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TCF3P15923 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TCF3P15923 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCF3P15923 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCF3P15923 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCF3P15923 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCF3P15923 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCF3P15923 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCF3P15923 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCF3P15923 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCF3P15923 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCF3P15923 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCF3P15923 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCF3P15923 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TCF3P15923 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCF3P15923 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCF3P15923 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCF3P15923 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCF3P15923 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCF3P15923 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCF3P15923 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCF3P15923 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCF3P15923 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCF3P15923 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCF3P15923 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCF3P15923 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCF3P15923 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCF3P15923 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCF3P15923 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCF3P15923 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCF3P15923 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF3P15923 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF3P15923 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCF3P15923 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCF3P15923 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCF3P15923 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCF3P15923 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCF3P15923 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCF3P15923 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCF3P15923 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCF3P15923 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TCF3P15923 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCF3P15923 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCF3P15923 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCF3P15923 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCF3P15923 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCF3P15923 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCF3P15923 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCF3P15923 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCF3P15923 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCF3P15923 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCF3P15923 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TCF3P15923 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TCF3P15923 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms