Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA1P14867 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRA1P14867 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRA1P14867 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms