Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HOXB2P14652 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXB2P14652 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB2P14652 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB2P14652 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXB2P14652 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB2P14652 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB2P14652 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB2P14652 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB2P14652 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB2P14652 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB2P14652 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB2P14652 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB2P14652 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB2P14652 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB2P14652 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms