Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2F2P13984 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2F2P13984 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2F2P13984 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2F2P13984 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2F2P13984 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2F2P13984 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2F2P13984 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2F2P13984 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2F2P13984 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2F2P13984 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2F2P13984 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2F2P13984 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2F2P13984 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2F2P13984 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2F2P13984 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2F2P13984 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 927.7 ms