Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT3P12035 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT3P12035 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT3P12035 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT3P12035 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT3P12035 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT3P12035 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT3P12035 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT3P12035 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT3P12035 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT3P12035 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT3P12035 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT3P12035 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT3P12035 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT3P12035 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT3P12035 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT3P12035 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT3P12035 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT3P12035 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT3P12035 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT3P12035 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT3P12035 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT3P12035 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT3P12035 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT3P12035 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT3P12035 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT3P12035 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT3P12035 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT3P12035 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT3P12035 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT3P12035 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT3P12035 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT3P12035 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT3P12035 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT3P12035 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT3P12035 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT3P12035 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT3P12035 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT3P12035 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT3P12035 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT3P12035 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT3P12035 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT3P12035 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT3P12035 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT3P12035 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT3P12035 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT3P12035 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT3P12035 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT3P12035 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT3P12035 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT3P12035 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT3P12035 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT3P12035 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT3P12035 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT3P12035 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT3P12035 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT3P12035 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT3P12035 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT3P12035 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT3P12035 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT3P12035 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT3P12035 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT3P12035 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT3P12035 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT3P12035 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT3P12035 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT3P12035 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT3P12035 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT3P12035 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT3P12035 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT3P12035 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT3P12035 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT3P12035 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT3P12035 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT3P12035 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT3P12035 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT3P12035 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT3P12035 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT3P12035 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT3P12035 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT3P12035 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT3P12035 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT3P12035 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT3P12035 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT3P12035 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT3P12035 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT3P12035 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT3P12035 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT3P12035 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT3P12035 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT3P12035 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT3P12035 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT3P12035 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT3P12035 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT3P12035 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT3P12035 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT3P12035 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT3P12035 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT3P12035 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT3P12035 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms