Protein–RNA interactions for Protein: P11362

FGFR1, Fibroblast growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR1P11362 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGFR1P11362 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGFR1P11362 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGFR1P11362 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGFR1P11362 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGFR1P11362 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGFR1P11362 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGFR1P11362 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FGFR1P11362 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGFR1P11362 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGFR1P11362 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGFR1P11362 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGFR1P11362 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGFR1P11362 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGFR1P11362 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGFR1P11362 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGFR1P11362 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGFR1P11362 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGFR1P11362 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGFR1P11362 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGFR1P11362 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGFR1P11362 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGFR1P11362 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGFR1P11362 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
FGFR1P11362 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms