Protein–RNA interactions for Protein: P10092

CALCB, Calcitonin gene-related peptide 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCBP10092 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCBP10092 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALCBP10092 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCBP10092 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCBP10092 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCBP10092 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCBP10092 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCBP10092 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCBP10092 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALCBP10092 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCBP10092 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCBP10092 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALCBP10092 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCBP10092 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCBP10092 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCBP10092 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALCBP10092 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCBP10092 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCBP10092 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCBP10092 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCBP10092 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCBP10092 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCBP10092 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALCBP10092 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCBP10092 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALCBP10092 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CALCBP10092 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCBP10092 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCBP10092 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALCBP10092 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALCBP10092 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALCBP10092 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCBP10092 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CALCBP10092 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALCBP10092 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALCBP10092 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCBP10092 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCBP10092 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCBP10092 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCBP10092 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCBP10092 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCBP10092 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCBP10092 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCBP10092 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCBP10092 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCBP10092 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCBP10092 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCBP10092 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCBP10092 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCBP10092 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCBP10092 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCBP10092 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCBP10092 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCBP10092 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCBP10092 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCBP10092 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCBP10092 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCBP10092 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCBP10092 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCBP10092 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCBP10092 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCBP10092 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCBP10092 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCBP10092 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCBP10092 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCBP10092 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCBP10092 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCBP10092 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCBP10092 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALCBP10092 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCBP10092 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCBP10092 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCBP10092 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCBP10092 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALCBP10092 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCBP10092 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCBP10092 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCBP10092 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCBP10092 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCBP10092 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCBP10092 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCBP10092 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCBP10092 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCBP10092 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCBP10092 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCBP10092 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCBP10092 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCBP10092 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCBP10092 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCBP10092 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCBP10092 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCBP10092 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCBP10092 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCBP10092 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCBP10092 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCBP10092 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCBP10092 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCBP10092 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCBP10092 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCBP10092 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms