Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APELAP0DMC3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APELAP0DMC3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms