Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NEFLP07196 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NEFLP07196 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NEFLP07196 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NEFLP07196 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NEFLP07196 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NEFLP07196 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NEFLP07196 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NEFLP07196 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NEFLP07196 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NEFLP07196 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NEFLP07196 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NEFLP07196 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEFLP07196 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEFLP07196 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEFLP07196 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEFLP07196 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
NEFLP07196 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
NEFLP07196 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NEFLP07196 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEFLP07196 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEFLP07196 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEFLP07196 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEFLP07196 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEFLP07196 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEFLP07196 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NEFLP07196 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NEFLP07196 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEFLP07196 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEFLP07196 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEFLP07196 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NEFLP07196 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NEFLP07196 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NEFLP07196 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NEFLP07196 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NEFLP07196 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NEFLP07196 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEFLP07196 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEFLP07196 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEFLP07196 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
NEFLP07196 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEFLP07196 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEFLP07196 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEFLP07196 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEFLP07196 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEFLP07196 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEFLP07196 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEFLP07196 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEFLP07196 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEFLP07196 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEFLP07196 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NEFLP07196 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NEFLP07196 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEFLP07196 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEFLP07196 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEFLP07196 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEFLP07196 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
NEFLP07196 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NEFLP07196 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NEFLP07196 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEFLP07196 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEFLP07196 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEFLP07196 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEFLP07196 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEFLP07196 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEFLP07196 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEFLP07196 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEFLP07196 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEFLP07196 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEFLP07196 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEFLP07196 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEFLP07196 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEFLP07196 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEFLP07196 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEFLP07196 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEFLP07196 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEFLP07196 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEFLP07196 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NEFLP07196 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEFLP07196 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NEFLP07196 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NEFLP07196 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEFLP07196 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEFLP07196 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEFLP07196 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEFLP07196 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEFLP07196 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEFLP07196 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEFLP07196 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEFLP07196 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
NEFLP07196 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NEFLP07196 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NEFLP07196 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NEFLP07196 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NEFLP07196 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NEFLP07196 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NEFLP07196 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NEFLP07196 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NEFLP07196 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
NEFLP07196 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms