Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDN1P05305 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDN1P05305 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDN1P05305 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDN1P05305 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDN1P05305 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDN1P05305 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDN1P05305 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EDN1P05305 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EDN1P05305 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EDN1P05305 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDN1P05305 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDN1P05305 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDN1P05305 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDN1P05305 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDN1P05305 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EDN1P05305 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDN1P05305 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDN1P05305 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EDN1P05305 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDN1P05305 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDN1P05305 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EDN1P05305 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EDN1P05305 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EDN1P05305 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDN1P05305 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDN1P05305 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDN1P05305 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDN1P05305 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDN1P05305 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDN1P05305 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EDN1P05305 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDN1P05305 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDN1P05305 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDN1P05305 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDN1P05305 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDN1P05305 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDN1P05305 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDN1P05305 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDN1P05305 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDN1P05305 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDN1P05305 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDN1P05305 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDN1P05305 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDN1P05305 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDN1P05305 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDN1P05305 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDN1P05305 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDN1P05305 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDN1P05305 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDN1P05305 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDN1P05305 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDN1P05305 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDN1P05305 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDN1P05305 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDN1P05305 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDN1P05305 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDN1P05305 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDN1P05305 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDN1P05305 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDN1P05305 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDN1P05305 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDN1P05305 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDN1P05305 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDN1P05305 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDN1P05305 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDN1P05305 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDN1P05305 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDN1P05305 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
EDN1P05305 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDN1P05305 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDN1P05305 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDN1P05305 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDN1P05305 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDN1P05305 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDN1P05305 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDN1P05305 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDN1P05305 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDN1P05305 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDN1P05305 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDN1P05305 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDN1P05305 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDN1P05305 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDN1P05305 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDN1P05305 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDN1P05305 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDN1P05305 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDN1P05305 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDN1P05305 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDN1P05305 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDN1P05305 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EDN1P05305 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDN1P05305 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDN1P05305 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDN1P05305 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDN1P05305 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDN1P05305 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDN1P05305 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDN1P05305 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDN1P05305 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms