Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFNW1P05000 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFNW1P05000 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNW1P05000 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNW1P05000 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNW1P05000 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNW1P05000 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNW1P05000 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNW1P05000 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNW1P05000 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNW1P05000 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNW1P05000 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNW1P05000 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNW1P05000 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNW1P05000 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNW1P05000 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNW1P05000 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNW1P05000 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNW1P05000 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNW1P05000 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms