Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF2P04141 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF2P04141 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF2P04141 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF2P04141 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF2P04141 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF2P04141 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF2P04141 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF2P04141 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF2P04141 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF2P04141 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF2P04141 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF2P04141 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF2P04141 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF2P04141 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF2P04141 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF2P04141 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF2P04141 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSF2P04141 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSF2P04141 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSF2P04141 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSF2P04141 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSF2P04141 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSF2P04141 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSF2P04141 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSF2P04141 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSF2P04141 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSF2P04141 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSF2P04141 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF2P04141 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF2P04141 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF2P04141 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF2P04141 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF2P04141 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF2P04141 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF2P04141 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF2P04141 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF2P04141 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF2P04141 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF2P04141 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF2P04141 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF2P04141 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF2P04141 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF2P04141 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF2P04141 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF2P04141 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF2P04141 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF2P04141 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSF2P04141 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSF2P04141 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSF2P04141 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF2P04141 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF2P04141 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF2P04141 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF2P04141 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF2P04141 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF2P04141 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF2P04141 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF2P04141 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF2P04141 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF2P04141 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF2P04141 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF2P04141 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CSF2P04141 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CSF2P04141 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF2P04141 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF2P04141 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF2P04141 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF2P04141 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF2P04141 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF2P04141 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF2P04141 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF2P04141 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF2P04141 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF2P04141 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF2P04141 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF2P04141 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF2P04141 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF2P04141 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF2P04141 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF2P04141 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF2P04141 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF2P04141 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSF2P04141 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF2P04141 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF2P04141 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF2P04141 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2P04141 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2P04141 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2P04141 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF2P04141 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF2P04141 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF2P04141 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF2P04141 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF2P04141 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF2P04141 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF2P04141 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF2P04141 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF2P04141 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF2P04141 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms