Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA1P02647 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA1P02647 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA1P02647 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA1P02647 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA1P02647 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOA1P02647 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA1P02647 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA1P02647 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA1P02647 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA1P02647 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA1P02647 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA1P02647 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA1P02647 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA1P02647 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA1P02647 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA1P02647 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA1P02647 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA1P02647 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA1P02647 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA1P02647 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA1P02647 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA1P02647 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA1P02647 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA1P02647 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA1P02647 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA1P02647 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA1P02647 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA1P02647 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA1P02647 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA1P02647 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA1P02647 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA1P02647 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA1P02647 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA1P02647 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOA1P02647 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOA1P02647 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA1P02647 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA1P02647 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA1P02647 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA1P02647 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA1P02647 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA1P02647 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA1P02647 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA1P02647 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA1P02647 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA1P02647 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOA1P02647 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA1P02647 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA1P02647 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA1P02647 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOA1P02647 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA1P02647 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA1P02647 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA1P02647 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOA1P02647 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA1P02647 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA1P02647 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA1P02647 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA1P02647 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA1P02647 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA1P02647 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOA1P02647 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA1P02647 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA1P02647 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA1P02647 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA1P02647 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA1P02647 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOA1P02647 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOA1P02647 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOA1P02647 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOA1P02647 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA1P02647 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA1P02647 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA1P02647 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA1P02647 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA1P02647 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA1P02647 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA1P02647 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA1P02647 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA1P02647 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA1P02647 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA1P02647 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA1P02647 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA1P02647 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA1P02647 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA1P02647 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA1P02647 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA1P02647 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA1P02647 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA1P02647 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA1P02647 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA1P02647 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA1P02647 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA1P02647 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA1P02647 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA1P02647 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA1P02647 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA1P02647 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA1P02647 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms