Protein–RNA interactions for Protein: P01876

IGHA1, Immunoglobulin heavy constant alpha 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHA1P01876 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHA1P01876 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHA1P01876 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHA1P01876 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGHA1P01876 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHA1P01876 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms