Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CST1P01037 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CST1P01037 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CST1P01037 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CST1P01037 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CST1P01037 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CST1P01037 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CST1P01037 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CST1P01037 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CST1P01037 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CST1P01037 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CST1P01037 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CST1P01037 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CST1P01037 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CST1P01037 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CST1P01037 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CST1P01037 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CST1P01037 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CST1P01037 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CST1P01037 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CST1P01037 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CST1P01037 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CST1P01037 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CST1P01037 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CST1P01037 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CST1P01037 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CST1P01037 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CST1P01037 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CST1P01037 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CST1P01037 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CST1P01037 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CST1P01037 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CST1P01037 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CST1P01037 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CST1P01037 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CST1P01037 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CST1P01037 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CST1P01037 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CST1P01037 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CST1P01037 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CST1P01037 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CST1P01037 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CST1P01037 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CST1P01037 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CST1P01037 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CST1P01037 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CST1P01037 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CST1P01037 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CST1P01037 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CST1P01037 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CST1P01037 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CST1P01037 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CST1P01037 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CST1P01037 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CST1P01037 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CST1P01037 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CST1P01037 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CST1P01037 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CST1P01037 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CST1P01037 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CST1P01037 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CST1P01037 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CST1P01037 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CST1P01037 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CST1P01037 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CST1P01037 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CST1P01037 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST1P01037 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST1P01037 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST1P01037 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST1P01037 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST1P01037 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CST1P01037 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CST1P01037 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CST1P01037 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CST1P01037 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CST1P01037 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CST1P01037 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CST1P01037 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST1P01037 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST1P01037 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST1P01037 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST1P01037 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST1P01037 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST1P01037 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST1P01037 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST1P01037 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST1P01037 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CST1P01037 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST1P01037 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST1P01037 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CST1P01037 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CST1P01037 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CST1P01037 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CST1P01037 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CST1P01037 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CST1P01037 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CST1P01037 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CST1P01037 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CST1P01037 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms