Protein–RNA interactions for Protein: P01011

SERPINA3, Alpha-1-antichymotrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA3P01011 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINA3P01011 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINA3P01011 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINA3P01011 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SERPINA3P01011 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms