Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC3O95833 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC3O95833 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC3O95833 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC3O95833 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC3O95833 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC3O95833 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC3O95833 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC3O95833 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC3O95833 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC3O95833 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC3O95833 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC3O95833 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC3O95833 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC3O95833 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIC3O95833 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIC3O95833 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLIC3O95833 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms