Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SEC24BO95487 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SEC24BO95487 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SEC24BO95487 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SEC24BO95487 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SEC24BO95487 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SEC24BO95487 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SEC24BO95487 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SEC24BO95487 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SEC24BO95487 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SEC24BO95487 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SEC24BO95487 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SEC24BO95487 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SEC24BO95487 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SEC24BO95487 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SEC24BO95487 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SEC24BO95487 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SEC24BO95487 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SEC24BO95487 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SEC24BO95487 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SEC24BO95487 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SEC24BO95487 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SEC24BO95487 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SEC24BO95487 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SEC24BO95487 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SEC24BO95487 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SEC24BO95487 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SEC24BO95487 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SEC24BO95487 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SEC24BO95487 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SEC24BO95487 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SEC24BO95487 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SEC24BO95487 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SEC24BO95487 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SEC24BO95487 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SEC24BO95487 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SEC24BO95487 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SEC24BO95487 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SEC24BO95487 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SEC24BO95487 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SEC24BO95487 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SEC24BO95487 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SEC24BO95487 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SEC24BO95487 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SEC24BO95487 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SEC24BO95487 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SEC24BO95487 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SEC24BO95487 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SEC24BO95487 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SEC24BO95487 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SEC24BO95487 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms