Protein–RNA interactions for Protein: O95183

VAMP5, Vesicle-associated membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP5O95183 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAMP5O95183 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP5O95183 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms