Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F6O75461 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F6O75461 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F6O75461 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F6O75461 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F6O75461 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F6O75461 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F6O75461 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F6O75461 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F6O75461 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F6O75461 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F6O75461 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F6O75461 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F6O75461 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F6O75461 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F6O75461 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F6O75461 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F6O75461 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F6O75461 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F6O75461 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F6O75461 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F6O75461 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F6O75461 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F6O75461 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F6O75461 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F6O75461 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F6O75461 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E2F6O75461 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E2F6O75461 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F6O75461 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F6O75461 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F6O75461 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F6O75461 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F6O75461 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F6O75461 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F6O75461 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F6O75461 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F6O75461 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F6O75461 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F6O75461 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F6O75461 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F6O75461 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F6O75461 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F6O75461 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F6O75461 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F6O75461 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F6O75461 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F6O75461 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F6O75461 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F6O75461 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F6O75461 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F6O75461 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F6O75461 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F6O75461 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F6O75461 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F6O75461 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F6O75461 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F6O75461 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F6O75461 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F6O75461 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F6O75461 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F6O75461 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F6O75461 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F6O75461 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F6O75461 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F6O75461 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F6O75461 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F6O75461 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F6O75461 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F6O75461 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F6O75461 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F6O75461 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F6O75461 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F6O75461 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F6O75461 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F6O75461 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F6O75461 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F6O75461 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F6O75461 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F6O75461 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F6O75461 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F6O75461 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F6O75461 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F6O75461 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F6O75461 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F6O75461 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F6O75461 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F6O75461 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F6O75461 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F6O75461 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F6O75461 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F6O75461 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F6O75461 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F6O75461 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F6O75461 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F6O75461 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F6O75461 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F6O75461 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F6O75461 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F6O75461 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms