Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMPCBO75439 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PMPCBO75439 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMPCBO75439 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PMPCBO75439 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.4 ms