Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPFIA4O75335 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPFIA4O75335 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPFIA4O75335 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPFIA4O75335 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms