Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GADD45BO75293 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GADD45BO75293 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GADD45BO75293 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GADD45BO75293 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GADD45BO75293 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GADD45BO75293 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GADD45BO75293 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GADD45BO75293 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GADD45BO75293 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GADD45BO75293 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GADD45BO75293 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GADD45BO75293 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GADD45BO75293 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GADD45BO75293 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GADD45BO75293 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GADD45BO75293 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GADD45BO75293 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GADD45BO75293 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GADD45BO75293 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GADD45BO75293 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GADD45BO75293 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GADD45BO75293 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GADD45BO75293 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GADD45BO75293 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GADD45BO75293 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GADD45BO75293 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GADD45BO75293 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GADD45BO75293 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GADD45BO75293 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GADD45BO75293 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GADD45BO75293 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GADD45BO75293 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GADD45BO75293 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GADD45BO75293 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GADD45BO75293 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GADD45BO75293 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GADD45BO75293 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GADD45BO75293 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GADD45BO75293 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GADD45BO75293 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GADD45BO75293 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GADD45BO75293 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GADD45BO75293 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GADD45BO75293 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GADD45BO75293 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GADD45BO75293 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GADD45BO75293 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GADD45BO75293 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GADD45BO75293 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GADD45BO75293 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GADD45BO75293 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GADD45BO75293 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GADD45BO75293 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GADD45BO75293 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms