Protein–RNA interactions for Protein: O75192

PEX11A, Peroxisomal membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11AO75192 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX11AO75192 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PEX11AO75192 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PEX11AO75192 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PEX11AO75192 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PEX11AO75192 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PEX11AO75192 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX11AO75192 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX11AO75192 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PEX11AO75192 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms