Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG13O75143 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG13O75143 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG13O75143 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG13O75143 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG13O75143 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG13O75143 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG13O75143 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATG13O75143 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG13O75143 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG13O75143 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG13O75143 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG13O75143 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG13O75143 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG13O75143 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG13O75143 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG13O75143 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG13O75143 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG13O75143 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG13O75143 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG13O75143 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG13O75143 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG13O75143 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG13O75143 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATG13O75143 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATG13O75143 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG13O75143 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG13O75143 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG13O75143 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG13O75143 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG13O75143 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG13O75143 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG13O75143 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG13O75143 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG13O75143 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG13O75143 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG13O75143 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG13O75143 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG13O75143 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG13O75143 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG13O75143 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG13O75143 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG13O75143 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG13O75143 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG13O75143 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG13O75143 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG13O75143 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATG13O75143 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATG13O75143 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG13O75143 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG13O75143 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG13O75143 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG13O75143 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG13O75143 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG13O75143 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG13O75143 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG13O75143 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG13O75143 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG13O75143 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG13O75143 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG13O75143 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG13O75143 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG13O75143 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG13O75143 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG13O75143 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG13O75143 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG13O75143 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG13O75143 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG13O75143 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG13O75143 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG13O75143 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG13O75143 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG13O75143 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG13O75143 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG13O75143 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG13O75143 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG13O75143 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG13O75143 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG13O75143 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG13O75143 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG13O75143 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG13O75143 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG13O75143 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG13O75143 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG13O75143 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG13O75143 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG13O75143 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG13O75143 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG13O75143 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG13O75143 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG13O75143 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG13O75143 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG13O75143 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG13O75143 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG13O75143 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG13O75143 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG13O75143 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG13O75143 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG13O75143 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG13O75143 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms