Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP3O75074 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP3O75074 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP3O75074 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP3O75074 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP3O75074 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP3O75074 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP3O75074 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP3O75074 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP3O75074 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP3O75074 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP3O75074 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP3O75074 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP3O75074 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP3O75074 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP3O75074 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP3O75074 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP3O75074 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP3O75074 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP3O75074 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP3O75074 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP3O75074 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP3O75074 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP3O75074 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP3O75074 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP3O75074 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP3O75074 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP3O75074 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP3O75074 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP3O75074 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP3O75074 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP3O75074 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP3O75074 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP3O75074 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP3O75074 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP3O75074 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP3O75074 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP3O75074 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRP3O75074 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRP3O75074 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRP3O75074 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRP3O75074 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRP3O75074 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP3O75074 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP3O75074 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP3O75074 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP3O75074 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP3O75074 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP3O75074 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP3O75074 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP3O75074 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP3O75074 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP3O75074 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP3O75074 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP3O75074 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP3O75074 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRP3O75074 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRP3O75074 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRP3O75074 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRP3O75074 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRP3O75074 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRP3O75074 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRP3O75074 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRP3O75074 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRP3O75074 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRP3O75074 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRP3O75074 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRP3O75074 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRP3O75074 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRP3O75074 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRP3O75074 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRP3O75074 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP3O75074 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP3O75074 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP3O75074 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP3O75074 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP3O75074 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP3O75074 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP3O75074 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP3O75074 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP3O75074 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP3O75074 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP3O75074 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP3O75074 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP3O75074 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP3O75074 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP3O75074 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP3O75074 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP3O75074 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP3O75074 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP3O75074 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP3O75074 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP3O75074 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP3O75074 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP3O75074 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP3O75074 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP3O75074 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP3O75074 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRP3O75074 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP3O75074 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms