Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
BRD4O60885 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
BRD4O60885 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
BRD4O60885 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
BRD4O60885 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
BRD4O60885 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
BRD4O60885 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
BRD4O60885 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
BRD4O60885 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
BRD4O60885 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
BRD4O60885 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
BRD4O60885 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BRD4O60885 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BRD4O60885 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BRD4O60885 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BRD4O60885 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
BRD4O60885 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
BRD4O60885 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
BRD4O60885 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
BRD4O60885 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
BRD4O60885 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
BRD4O60885 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BRD4O60885 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
BRD4O60885 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
BRD4O60885 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
BRD4O60885 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
BRD4O60885 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
BRD4O60885 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
BRD4O60885 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
BRD4O60885 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
BRD4O60885 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
BRD4O60885 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
BRD4O60885 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
BRD4O60885 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
BRD4O60885 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
BRD4O60885 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
BRD4O60885 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.26
BRD4O60885 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
BRD4O60885 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
BRD4O60885 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
BRD4O60885 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
BRD4O60885 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
BRD4O60885 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
BRD4O60885 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
BRD4O60885 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
BRD4O60885 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
BRD4O60885 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BRD4O60885 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BRD4O60885 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BRD4O60885 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
BRD4O60885 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
BRD4O60885 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
BRD4O60885 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
BRD4O60885 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
BRD4O60885 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
BRD4O60885 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
BRD4O60885 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
BRD4O60885 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
BRD4O60885 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
BRD4O60885 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BRD4O60885 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
BRD4O60885 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
BRD4O60885 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
BRD4O60885 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
BRD4O60885 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
BRD4O60885 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
BRD4O60885 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
BRD4O60885 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
BRD4O60885 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
BRD4O60885 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
BRD4O60885 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
BRD4O60885 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
BRD4O60885 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
BRD4O60885 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
BRD4O60885 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
BRD4O60885 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
BRD4O60885 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
BRD4O60885 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
BRD4O60885 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
BRD4O60885 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
BRD4O60885 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
BRD4O60885 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
BRD4O60885 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
BRD4O60885 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
BRD4O60885 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
BRD4O60885 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
BRD4O60885 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
BRD4O60885 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
BRD4O60885 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
BRD4O60885 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
BRD4O60885 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
BRD4O60885 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
BRD4O60885 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
BRD4O60885 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
BRD4O60885 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
BRD4O60885 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
BRD4O60885 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
BRD4O60885 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
BRD4O60885 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
BRD4O60885 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms