Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GFRA3O60609 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GFRA3O60609 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GFRA3O60609 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GFRA3O60609 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GFRA3O60609 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GFRA3O60609 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GFRA3O60609 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GFRA3O60609 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GFRA3O60609 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GFRA3O60609 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GFRA3O60609 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GFRA3O60609 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GFRA3O60609 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GFRA3O60609 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GFRA3O60609 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GFRA3O60609 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GFRA3O60609 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GFRA3O60609 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GFRA3O60609 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GFRA3O60609 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GFRA3O60609 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GFRA3O60609 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GFRA3O60609 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GFRA3O60609 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GFRA3O60609 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GFRA3O60609 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GFRA3O60609 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GFRA3O60609 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GFRA3O60609 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GFRA3O60609 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GFRA3O60609 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GFRA3O60609 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms