Protein–RNA interactions for Protein: O60315

ZEB2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB2O60315 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZEB2O60315 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZEB2O60315 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZEB2O60315 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ZEB2O60315 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ZEB2O60315 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ZEB2O60315 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ZEB2O60315 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB2O60315 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB2O60315 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB2O60315 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZEB2O60315 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZEB2O60315 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZEB2O60315 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB2O60315 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZEB2O60315 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZEB2O60315 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB2O60315 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZEB2O60315 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms