Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS11DO60235 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS11DO60235 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMPRSS11DO60235 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS11DO60235 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms