Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX5O60225 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX5O60225 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX5O60225 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX5O60225 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX5O60225 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX5O60225 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX5O60225 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX5O60225 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX5O60225 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX5O60225 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX5O60225 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX5O60225 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX5O60225 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX5O60225 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX5O60225 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX5O60225 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX5O60225 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX5O60225 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX5O60225 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX5O60225 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX5O60225 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX5O60225 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX5O60225 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX5O60225 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX5O60225 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX5O60225 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX5O60225 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX5O60225 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX5O60225 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX5O60225 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX5O60225 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX5O60225 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX5O60225 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX5O60225 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX5O60225 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX5O60225 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX5O60225 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX5O60225 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX5O60225 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX5O60225 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX5O60225 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX5O60225 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX5O60225 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX5O60225 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX5O60225 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX5O60225 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX5O60225 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX5O60225 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX5O60225 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX5O60225 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX5O60225 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX5O60225 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
SSX5O60225 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX5O60225 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX5O60225 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX5O60225 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX5O60225 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX5O60225 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX5O60225 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX5O60225 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX5O60225 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX5O60225 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX5O60225 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX5O60225 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX5O60225 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX5O60225 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX5O60225 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX5O60225 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX5O60225 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX5O60225 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX5O60225 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX5O60225 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX5O60225 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX5O60225 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX5O60225 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX5O60225 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX5O60225 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX5O60225 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX5O60225 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX5O60225 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX5O60225 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX5O60225 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX5O60225 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSX5O60225 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX5O60225 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSX5O60225 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX5O60225 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX5O60225 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX5O60225 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX5O60225 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX5O60225 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX5O60225 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX5O60225 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX5O60225 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX5O60225 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSX5O60225 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX5O60225 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX5O60225 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX5O60225 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms