Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AIREO43918 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AIREO43918 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AIREO43918 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AIREO43918 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AIREO43918 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AIREO43918 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AIREO43918 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AIREO43918 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AIREO43918 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AIREO43918 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AIREO43918 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AIREO43918 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AIREO43918 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AIREO43918 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AIREO43918 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AIREO43918 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AIREO43918 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AIREO43918 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AIREO43918 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AIREO43918 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AIREO43918 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AIREO43918 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AIREO43918 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AIREO43918 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AIREO43918 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AIREO43918 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AIREO43918 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AIREO43918 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AIREO43918 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AIREO43918 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AIREO43918 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AIREO43918 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AIREO43918 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AIREO43918 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AIREO43918 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AIREO43918 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AIREO43918 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AIREO43918 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AIREO43918 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AIREO43918 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AIREO43918 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AIREO43918 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AIREO43918 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AIREO43918 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AIREO43918 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AIREO43918 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AIREO43918 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AIREO43918 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AIREO43918 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AIREO43918 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AIREO43918 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AIREO43918 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AIREO43918 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIREO43918 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIREO43918 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIREO43918 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIREO43918 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIREO43918 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIREO43918 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIREO43918 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIREO43918 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AIREO43918 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AIREO43918 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AIREO43918 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AIREO43918 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AIREO43918 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AIREO43918 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AIREO43918 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AIREO43918 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIREO43918 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIREO43918 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AIREO43918 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AIREO43918 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AIREO43918 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AIREO43918 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AIREO43918 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AIREO43918 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AIREO43918 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AIREO43918 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AIREO43918 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AIREO43918 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AIREO43918 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AIREO43918 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AIREO43918 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AIREO43918 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AIREO43918 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AIREO43918 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AIREO43918 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AIREO43918 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AIREO43918 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AIREO43918 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AIREO43918 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AIREO43918 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AIREO43918 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AIREO43918 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AIREO43918 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AIREO43918 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AIREO43918 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AIREO43918 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms