Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BUD23O43709 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BUD23O43709 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BUD23O43709 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BUD23O43709 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BUD23O43709 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BUD23O43709 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BUD23O43709 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BUD23O43709 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BUD23O43709 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BUD23O43709 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BUD23O43709 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BUD23O43709 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BUD23O43709 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BUD23O43709 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BUD23O43709 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BUD23O43709 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BUD23O43709 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BUD23O43709 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BUD23O43709 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BUD23O43709 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BUD23O43709 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BUD23O43709 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BUD23O43709 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BUD23O43709 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BUD23O43709 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BUD23O43709 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BUD23O43709 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BUD23O43709 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BUD23O43709 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BUD23O43709 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BUD23O43709 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BUD23O43709 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BUD23O43709 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BUD23O43709 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BUD23O43709 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BUD23O43709 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BUD23O43709 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BUD23O43709 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BUD23O43709 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BUD23O43709 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BUD23O43709 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BUD23O43709 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BUD23O43709 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BUD23O43709 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BUD23O43709 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BUD23O43709 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BUD23O43709 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BUD23O43709 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BUD23O43709 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BUD23O43709 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BUD23O43709 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BUD23O43709 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BUD23O43709 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BUD23O43709 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BUD23O43709 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BUD23O43709 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BUD23O43709 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BUD23O43709 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BUD23O43709 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BUD23O43709 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BUD23O43709 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BUD23O43709 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BUD23O43709 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BUD23O43709 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BUD23O43709 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BUD23O43709 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BUD23O43709 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BUD23O43709 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BUD23O43709 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BUD23O43709 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BUD23O43709 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BUD23O43709 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BUD23O43709 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BUD23O43709 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BUD23O43709 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BUD23O43709 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BUD23O43709 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BUD23O43709 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BUD23O43709 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BUD23O43709 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BUD23O43709 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BUD23O43709 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BUD23O43709 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BUD23O43709 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BUD23O43709 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BUD23O43709 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BUD23O43709 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BUD23O43709 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BUD23O43709 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BUD23O43709 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BUD23O43709 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BUD23O43709 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BUD23O43709 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BUD23O43709 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BUD23O43709 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BUD23O43709 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BUD23O43709 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BUD23O43709 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BUD23O43709 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms