Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUV39H1O43463 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUV39H1O43463 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SUV39H1O43463 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUV39H1O43463 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUV39H1O43463 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUV39H1O43463 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUV39H1O43463 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUV39H1O43463 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUV39H1O43463 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUV39H1O43463 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUV39H1O43463 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SUV39H1O43463 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUV39H1O43463 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUV39H1O43463 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUV39H1O43463 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms