Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SIAH2O43255 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIAH2O43255 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIAH2O43255 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIAH2O43255 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms