Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLOCKO15516 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLOCKO15516 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLOCKO15516 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.6 ms