Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUPL2O15504 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUPL2O15504 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUPL2O15504 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 724.9 ms