Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHOX2AO14813 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHOX2AO14813 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PHOX2AO14813 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHOX2AO14813 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms