Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
POLR3AO14802 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
POLR3AO14802 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
POLR3AO14802 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
POLR3AO14802 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
POLR3AO14802 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
POLR3AO14802 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
POLR3AO14802 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
POLR3AO14802 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
POLR3AO14802 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
POLR3AO14802 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
POLR3AO14802 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
POLR3AO14802 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
POLR3AO14802 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
POLR3AO14802 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
POLR3AO14802 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
POLR3AO14802 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
POLR3AO14802 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
POLR3AO14802 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
POLR3AO14802 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
POLR3AO14802 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
POLR3AO14802 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
POLR3AO14802 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
POLR3AO14802 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
POLR3AO14802 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
POLR3AO14802 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
POLR3AO14802 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
POLR3AO14802 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
POLR3AO14802 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
POLR3AO14802 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
POLR3AO14802 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
POLR3AO14802 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
POLR3AO14802 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
POLR3AO14802 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
POLR3AO14802 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
POLR3AO14802 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms