Protein–RNA interactions for Protein: O00746

NME4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4O00746 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NME4O00746 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME4O00746 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME4O00746 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME4O00746 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME4O00746 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME4O00746 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME4O00746 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME4O00746 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME4O00746 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME4O00746 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME4O00746 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NME4O00746 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME4O00746 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME4O00746 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME4O00746 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME4O00746 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME4O00746 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME4O00746 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME4O00746 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME4O00746 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NME4O00746 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NME4O00746 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NME4O00746 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NME4O00746 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NME4O00746 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME4O00746 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME4O00746 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NME4O00746 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME4O00746 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME4O00746 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME4O00746 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME4O00746 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME4O00746 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME4O00746 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME4O00746 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME4O00746 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NME4O00746 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME4O00746 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME4O00746 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME4O00746 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NME4O00746 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME4O00746 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME4O00746 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME4O00746 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME4O00746 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME4O00746 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME4O00746 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME4O00746 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME4O00746 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME4O00746 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME4O00746 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME4O00746 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME4O00746 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME4O00746 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME4O00746 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME4O00746 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NME4O00746 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NME4O00746 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME4O00746 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME4O00746 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME4O00746 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME4O00746 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME4O00746 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NME4O00746 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME4O00746 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME4O00746 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NME4O00746 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NME4O00746 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME4O00746 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME4O00746 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME4O00746 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME4O00746 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME4O00746 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME4O00746 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME4O00746 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME4O00746 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME4O00746 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME4O00746 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME4O00746 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME4O00746 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME4O00746 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME4O00746 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME4O00746 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME4O00746 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NME4O00746 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NME4O00746 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME4O00746 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME4O00746 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME4O00746 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME4O00746 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME4O00746 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME4O00746 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME4O00746 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NME4O00746 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME4O00746 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME4O00746 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME4O00746 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME4O00746 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME4O00746 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms