Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCR6O00574 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCR6O00574 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCR6O00574 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CXCR6O00574 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR6O00574 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXCR6O00574 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR6O00574 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms