Protein–RNA interactions for Protein: O00534

VWA5A, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5AO00534 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VWA5AO00534 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VWA5AO00534 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VWA5AO00534 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VWA5AO00534 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VWA5AO00534 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VWA5AO00534 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VWA5AO00534 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VWA5AO00534 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VWA5AO00534 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VWA5AO00534 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VWA5AO00534 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VWA5AO00534 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VWA5AO00534 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
VWA5AO00534 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VWA5AO00534 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VWA5AO00534 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VWA5AO00534 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
VWA5AO00534 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VWA5AO00534 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VWA5AO00534 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VWA5AO00534 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VWA5AO00534 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VWA5AO00534 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VWA5AO00534 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VWA5AO00534 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VWA5AO00534 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VWA5AO00534 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VWA5AO00534 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VWA5AO00534 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VWA5AO00534 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
VWA5AO00534 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
VWA5AO00534 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VWA5AO00534 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VWA5AO00534 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VWA5AO00534 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VWA5AO00534 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWA5AO00534 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
VWA5AO00534 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
VWA5AO00534 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
VWA5AO00534 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWA5AO00534 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms