Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
I3L3M4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
I3L3M4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
I3L3M4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
I3L3M4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
I3L3M4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
I3L3M4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
I3L3M4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
I3L3M4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
I3L3M4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
I3L3M4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
I3L3M4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
I3L3M4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
I3L3M4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
I3L3M4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
I3L3M4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
I3L3M4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
I3L3M4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
I3L3M4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
I3L3M4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
I3L3M4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
I3L3M4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
I3L3M4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
I3L3M4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
I3L3M4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
I3L3M4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
I3L3M4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
I3L3M4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
I3L3M4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
I3L3M4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
I3L3M4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
I3L3M4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
I3L3M4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
I3L3M4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
I3L3M4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
I3L3M4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
I3L3M4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
I3L3M4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
I3L3M4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
I3L3M4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
I3L3M4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
I3L3M4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
I3L3M4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
I3L3M4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
I3L3M4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
I3L3M4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
I3L3M4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
I3L3M4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
I3L3M4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
I3L3M4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
I3L3M4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
I3L3M4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
I3L3M4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
I3L3M4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
I3L3M4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
I3L3M4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
I3L3M4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
I3L3M4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
I3L3M4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
I3L3M4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
I3L3M4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
I3L3M4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
I3L3M4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
I3L3M4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
I3L3M4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
I3L3M4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
I3L3M4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
I3L3M4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
I3L3M4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
I3L3M4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
I3L3M4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
I3L3M4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
I3L3M4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
I3L3M4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
I3L3M4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
I3L3M4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
I3L3M4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
I3L3M4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
I3L3M4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
I3L3M4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
I3L3M4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
I3L3M4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
I3L3M4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
I3L3M4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
I3L3M4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
I3L3M4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
I3L3M4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
I3L3M4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
I3L3M4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
I3L3M4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
I3L3M4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
I3L3M4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
I3L3M4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
I3L3M4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
I3L3M4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
I3L3M4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
I3L3M4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
I3L3M4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
I3L3M4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
I3L3M4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms