Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
H7C1D1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
H7C1D1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
H7C1D1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
H7C1D1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
H7C1D1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
H7C1D1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
H7C1D1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
H7C1D1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
H7C1D1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
H7C1D1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
H7C1D1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
H7C1D1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
H7C1D1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
H7C1D1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
H7C1D1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
H7C1D1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
H7C1D1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
H7C1D1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
H7C1D1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
H7C1D1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
H7C1D1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
H7C1D1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
H7C1D1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
H7C1D1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
H7C1D1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
H7C1D1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
H7C1D1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
H7C1D1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
H7C1D1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
H7C1D1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
H7C1D1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
H7C1D1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
H7C1D1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
H7C1D1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
H7C1D1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
H7C1D1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
H7C1D1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
H7C1D1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
H7C1D1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
H7C1D1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
H7C1D1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
H7C1D1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
H7C1D1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
H7C1D1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
H7C1D1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
H7C1D1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
H7C1D1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
H7C1D1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
H7C1D1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
H7C1D1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
H7C1D1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
H7C1D1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
H7C1D1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
H7C1D1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
H7C1D1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
H7C1D1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
H7C1D1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
H7C1D1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
H7C1D1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
H7C1D1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
H7C1D1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
H7C1D1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
H7C1D1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
H7C1D1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
H7C1D1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
H7C1D1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
H7C1D1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
H7C1D1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
H7C1D1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
H7C1D1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
H7C1D1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
H7C1D1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
H7C1D1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
H7C1D1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
H7C1D1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
H7C1D1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
H7C1D1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
H7C1D1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
H7C1D1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
H7C1D1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
H7C1D1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
H7C1D1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
H7C1D1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
H7C1D1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
H7C1D1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
H7C1D1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
H7C1D1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
H7C1D1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
H7C1D1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
H7C1D1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
H7C1D1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
H7C1D1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
H7C1D1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
H7C1D1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
H7C1D1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
H7C1D1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
H7C1D1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
H7C1D1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
H7C1D1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms