Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms