Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
F8VP50 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
F8VP50 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
F8VP50 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
F8VP50 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
F8VP50 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
F8VP50 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
F8VP50 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
F8VP50 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
F8VP50 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
F8VP50 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
F8VP50 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
F8VP50 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
F8VP50 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
F8VP50 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
F8VP50 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
F8VP50 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
F8VP50 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
F8VP50 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
F8VP50 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
F8VP50 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
F8VP50 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
F8VP50 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
F8VP50 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
F8VP50 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
F8VP50 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
F8VP50 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
F8VP50 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
F8VP50 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
F8VP50 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
F8VP50 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
F8VP50 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
F8VP50 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
F8VP50 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
F8VP50 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
F8VP50 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
F8VP50 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
F8VP50 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
F8VP50 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
F8VP50 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
F8VP50 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
F8VP50 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
F8VP50 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
F8VP50 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
F8VP50 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
F8VP50 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
F8VP50 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
F8VP50 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
F8VP50 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
F8VP50 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
F8VP50 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
F8VP50 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27■■□□□ 1.91
F8VP50 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
F8VP50 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
F8VP50 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27■■□□□ 1.91
F8VP50 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
F8VP50 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
F8VP50 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
F8VP50 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
F8VP50 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
F8VP50 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
F8VP50 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
F8VP50 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
F8VP50 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
F8VP50 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
F8VP50 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
F8VP50 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
F8VP50 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
F8VP50 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
F8VP50 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
F8VP50 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
F8VP50 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
F8VP50 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
F8VP50 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
F8VP50 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
F8VP50 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
F8VP50 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
F8VP50 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
F8VP50 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
F8VP50 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
F8VP50 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
F8VP50 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
F8VP50 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
F8VP50 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
F8VP50 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
F8VP50 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
F8VP50 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
F8VP50 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
F8VP50 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
F8VP50 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
F8VP50 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
F8VP50 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
F8VP50 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
F8VP50 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
F8VP50 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
F8VP50 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
F8VP50 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
F8VP50 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
F8VP50 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
F8VP50 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms