Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPIPB6E9PJ23 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NPIPB6E9PJ23 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPIPB6E9PJ23 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms