Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDCB7Z8K6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRDCB7Z8K6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms