Protein–RNA interactions for Protein: A6NM11

LRRC37A2, Leucine-rich repeat-containing protein 37A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC37A2A6NM11 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC37A2A6NM11 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC37A2A6NM11 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC37A2A6NM11 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC37A2A6NM11 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC37A2A6NM11 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC37A2A6NM11 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC37A2A6NM11 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC37A2A6NM11 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC37A2A6NM11 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC37A2A6NM11 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC37A2A6NM11 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LRRC37A2A6NM11 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC37A2A6NM11 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC37A2A6NM11 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC37A2A6NM11 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC37A2A6NM11 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC37A2A6NM11 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC37A2A6NM11 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC37A2A6NM11 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC37A2A6NM11 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC37A2A6NM11 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC37A2A6NM11 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC37A2A6NM11 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC37A2A6NM11 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC37A2A6NM11 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC37A2A6NM11 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms